Ekstrakurikuler Tapak Suci merupakan ekstrakurikuler bela diri yang berasal dari Muhammadiyah. SMK Muhammadiyah 3 Purbalingga menjalankan ekstrakurikuler Tapak Suci menjadi wadah bagi siswa dan siswi sebagai bentuk melestarikan bela diri asli Muhammadiyah.
Selain itu, melalui Tapak Suci siswa-siswi mampu mengendalikan dan memiliki kontrol diri dari berbagai hal-hal yang merugikan.
Tujuan dari ekstrakurikuler Tapak Suci adalah sebagai berikut:
- Menumbuhkan sikap disiplin siswa.
- Menciptakan kondisi bugar dan prima sehingga dapat berpikir secara optimal.
- Menumbuhkan dan meningkatkan rasa percaya diri siswa.
- Menumbuhkan sikap sportif dan saling menghargai.
- Memperoleh prestasi.